A secretaria é a alma da coordenação do PPGBot, responsável por administrar as demandas oriundas da CAPES, das Pró-Reitorias e da Reitoria da UEFS, além de atender às necessidades de discentes e docentes do programa. Entre suas atribuições estão o gerenciamento de e-mails, a organização de reuniões do Colegiado, a inserção e tramitação de documentos via SEI na Divisão de Assuntos Acadêmicos (DAA) da UEFS e a inclusão de dados na Plataforma Sucupira em conjunto com a coordenação do programa.
Infraestrutura: A sala conta com mesas e cadeiras, armários para armazenamento de documentos e materiais, além de equipamentos de informática e almoxarifado. Dispõe de computadores, impressora corporativa e acesso à rede de internet. Também possui geladeira, armário de utensílios, filtro de água e micro-ondas. Os custos com impressão (toner) e água são cobertos pela administração da UEFS.
Localização: A secretaria do programa está localizada no andar superior do prédio de Laboratórios de Pesquisa do Departamento de Ciências Biológicas (LABIO).


Secretária atual:
Janine Costa Cerqueira
Secretário(a)s anteriores:
2016 – 2025 – Daniela Rodrigues Soares
2003 – 2024 – Gardênia Maria Araújo Aires
2014 – 2016 – Fredson de Sá Maia
2000 – 2014 – Adriana Estrela Santos